闇の中で英雄たちが騙しあい殺しあうデスゲームが展開される日々に、衛宮士郎は後輩の間桐桜と心身の距離を縮めていく。しかし桜の祖父、間桐臓硯が戦いの前面に出て、その過去からつづく計画が明かされ、士郎は究極の選択をつきつけられる…… 三部作の二作目…