地球防衛軍の活躍により、多くの怪獣は眠りについた。ゴジラもまた轟天号との戦いで南極の氷に埋もれていった。 しかし20年後、さまざまな異変とともに怪獣が活発化する。ふたたび危機におちいった人類に、X星人が手をさしのべたが…… 北村龍平監督をむかえて…